RFID系統的前端軟件（前臺軟件）和中間件的主要作用是對數據進行收集和整理，最終對數據進行記錄，而實現企業(yè)管理功能的是其后端軟件（后臺軟件或應用軟件）。由于信息是為生產決策服務的，所以RFID系統所采集的信息最終要向后端軟件傳送，后端軟件系統需要具備相應的處理RFID數據的功能。后端軟件的具體數據處理功能和結構需要根據客戶的具體需求和決策的支持度來進行設計。
      就目前的應用而言，RFID系統的后端軟件既有針對高端市場的，也有為中、小企業(yè)開發(fā)的。它大致可以分成兩類，用于實現最基本記錄分析功能的軟件和企業(yè)資源規(guī)劃應用中的應用軟件。前者的主要應用有門禁管理軟件、小區(qū)停車管理軟件等，由于其功能較少，成本較低，所以很多都作為硬件設備的附贈品提供給公司用戶使用。后者主要用在企業(yè)資源計劃（Enterprise Resource Planning，ERP）系統的概念軟件上，外加了RFID功能或進行了一些改造后的ERP軟件，因此其價格很難固定，主要取決于企業(yè)的規(guī)模和軟件模塊的數量。
采用RFID技術的后端管理軟件大致可以分為以下3種情況。
（1）采用RFID技術之前，企業(yè)或公司內部都有自己的管理軟件系統，這些系統的數據可能是手工輸入或者通過條形碼識別系統輸入的。如果該程序的數據接口定義良好，則RFID中間件的設計將會非常簡單，這樣數據對于后端軟件將會變得透明。

（2）如果后端管理軟件的接口定義得不夠完美，則需要重新修改才能接受RFID中間件提供的規(guī)格化數據。
（3）大多數情況下，RFID的數據模式在過去的企業(yè)系統中尚未有過，因此需要重新開發(fā)或購買。
     后端管理軟件由中心數據服務器和管理終端組成，是系統的數據中心，它負責與讀寫器通信，將讀寫器經過中間件轉換之后的數據插入后臺業(yè)務倉庫管理系統的數據庫中，對電子標簽管理信息、電子標簽和采集的電子標簽信息集中進行存儲和處理。一般來說，后端管理軟件需要完成以下功能。
（1）RFID系統管理：系統設置及系統用戶信息和權限的設置。
（2）電子標簽管理：在數據庫中管理電子標簽序列號和每個物品對應的序號和產品名稱、型號規(guī)格、芯片內記錄的詳細信息等，完成數據庫內所有電子標簽的信息更新。
（3）數據分析和儲存：對整個系統內的數據進行統計分析，生成相關報表，并對采集到的數據進行存儲和管理